分集 共23集
《秘密部队》第 2 季 分集剧情共 23 集
第1集：换防2006年9月19日
麦克接到调令，蒂菲与他一同面对换防带来的种种后果。与此同时，行动组被派往巴基斯坦，必须阻止一场针对西方世界多个城市的生物武器袭击。
第2集：非常引渡2006年9月26日
小队潜入保加利亚，要帮助一名前行动组叛逃成员从监狱中逃脱，借以追查世界顶级军火商的线索。后方，莫莉为了照顾生病的母亲，接受了一份一次性招募工作，试图从行动组挖走一个有潜力的年轻人，为此做出了艰难抉择。
第3集：杀戮地带2006年10月3日
小队原定前往巴拉圭清除一名民兵叛军首领的任务被迫叫停，转而营救两名被狙击手困住的特战队员，并收回一名阵亡队友的遗体。回到后方，妻子们帮助死者的未婚妻争取两个继女的抚养权。
展开其余 20 集剧情
第4集：天罗地网2006年10月10日
小队全力追捕一名企图对核废料列车发动袭击的恐怖分子。后方，金看到女儿塞雷娜在校外与一名陌生男子交谈，顿生警觉。
第5集：不可抗力2006年10月17日
飓风来袭，小队被派往北卡罗来纳州一家医院，撤离一名在此接受治疗的非洲流亡独裁者，却发现医院里还有其他病人被遗弃。后方，莫莉在是否要满足儿子杰里米上伊拉克前线的请求之间挣扎；蒂菲与麦克决定再要一个孩子。
第6集：旧日情怀周2006年10月31日
小队的妻子们筹办“旧日情怀周”活动，为驻伊部队及家属募集善款。另一头，小队被派往非洲追查一批走私钻石的流向，鲍勃在此过程中发现了行动组一个深藏多年的秘密。金发现了一封1944年阵亡士兵未能寄出的情书，她设法通过这名士兵的战友找到其遗孀，将信送达。
第7集：帐外活动2006年11月7日
乔纳斯与鲍勃利用私人时间，为老朋友罗恩·奇尔斯办一件私事——将其女儿从一个企图逃离美国的宗教组织中救出，事情却变得异常复杂。后方，蒂菲目睹夏洛特·瑞安驾车发生事故并在其车内发现药片，出于愧疚替她向警方顶罪，由此陷入远比预想更严重的麻烦之中。
第8集：物竞天择2006年11月14日
鲍勃与翻译员在俄罗斯偏远地区遭遇直升机坠毁后幸存。在极端恶劣的环境中，没有任何装备可用，鲍勃为救翻译员拼死挣扎，并不断闪回当初通过选拔进入行动组的种种考验。
第9集：例外报告2006年11月21日
小队奉命暗杀一名威胁美国石油供应的南美高级官员。行动期间，一名参议员向媒体泄露机密情报，致使小队身陷险境。汤姆·瑞安上校前往华盛顿，在国会简报会上为行动组的任务进行辩护。
第10集：诱饵2006年11月28日
乔纳斯在格鲁吉亚共和国被俘，他主动充当筹码，要求美方释放一名在押的高级叛军首领。瑞安上校在华盛顿寻求合作的努力宣告失败，随即命令小队自行展开换囚行动。后方，蒂菲面临一场几乎必败的法庭审判；夏洛特·瑞安仍拒绝站出来说出真相，但以其他方式提供了帮助。
第11集：银星勋章2006年12月12日
乔纳斯的父亲因在朝鲜战争中的英勇表现被授予银星勋章，全家人为此庆祝。然而，乔纳斯的侄子——一名年轻士兵——把战斗留下的创伤发泄在妻子身上，惹出麻烦。另一边，麦克和鲍勃接到紧急求助：一架飞机的驾驶员神秘死亡，他们必须帮助唯一会开飞机的乘客安全降落。
第12集：扫帚间2007年1月16日
乔纳斯被总统亲自召见：在率队前往亚洲为一位参议员执行安保任务的同时，他还必须秘密介入总统的一项秘密外交，阻止这位参议员乱搞外交政策。后方，妻子们帮助杰里米为克里斯托准备一个惊喜。
第13集：潜意识2007年2月6日
鲍勃首次担任任务督导，但金把关乎任务的梦境告诉了朋友，导致行动面临暴露的风险。另一边，乔纳斯遭遇一位不合作的船长，必须想方设法完成科学家的营救任务。
第14集：约翰尼·B·古德2007年2月6日
一次伊朗行动中一切都出了差错。面对联合国调查的压力，少将以闪回的方式对这次任务进行复盘审查。种种压力之下，每个人所受的影响各不相同。
第15集：碧波万顷2007年2月13日
乔纳斯及队友在联合国大楼执行护卫任务，期间接连发生多起危机。另一边，莫莉与蒂菲四处寻找一名失踪的士兵。
第16集：偶然游戏2007年2月20日
特种部队版的“奥运会”开赛，乔纳斯率队与各国特种作战单位同场竞技，却无意中撞见一个真正的威胁。后方，金飞往犹他州出差，与旧情人重逢，陷入感情漩涡。
第17集：月暗无光2007年2月27日
行动组在巴基斯坦瓦济里斯坦地区押解三名恐怖嫌犯，途中与当地部队爆发冲突，被迫在一处美军前沿支援基地暂避。基地指挥官威信全无，一名狂妄自大的中士不仅威胁到任务本身，更将所有人的性命置于险境——乔纳斯被迫接管联合指挥权，准备迎击来犯之敌。
第18集：两枚硬币2007年3月20日
小队前往以色列学习应对自杀式炸弹威胁的新战术。查尔斯对一名以色列女兵产生好感，两人单独外出时陷入危险境地。后方，蒂菲意外获得一批二战纪念物，由此陷入一场良心危机，在道义与诱惑之间苦苦挣扎。
第19集：局外人2007年4月3日
鲍勃与赫克托奉命前往巴布亚新几内亚，回收一架被击落的美军飞机黑匣子。残骸坠落在部落圣地上，他们必须通过参与部落仪式来获得首肯。后方，克里斯托为报复麦克的拒绝，向记者泄露消息，令整个小队及国家安全面临威胁。
第20集：代行亲职2007年4月10日
弗吉尼亚州一所知名学校发生劫持事件，行动组协助特警队处置危机，必须在不伤及学生的情况下解救人质。后方，蒂菲过去的婚外情开始波及到女儿莉茜。
第21集：同床异梦2007年4月24日
鲍勃在战场上被迫做出艰难抉择。麦克认定蒂菲有外遇，家庭战线陷入动荡，最终做出了一个改变命运的决定。
第22集：自由落体2007年5月1日
麦克、格雷和威廉姆斯在美国本土保护来访的泰国王子一家，却发现皇室内部充满阴谋、诱惑与背叛，甚至涉及不忠与谋杀——他们能否保住王子，使其不丧命于自己家族之手？另一边，不听瑞安劝阻的乔纳斯在久战疲惫状态下加入鲍勃的行动，从四万英尺高空跳伞追击一名恐怖分子头目。然而，空中突发故障，乔纳斯的首要任务瞬间变为全力保住鲍勃的性命。
第23集：失乐园2007年5月8日
小队完成一次成功任务后归来，却发现自己的世界轰然崩塌——行动组被政府勒令解散，全体成员因过去的隐秘行动遭到调查，面临军事法庭的审判。瑞安上校被解除指挥权，将在耻辱中退役。莫莉和妻子们苦心经营多年的社区，眼看就要分崩离析、随风而散。