分集 共21集
《识骨寻踪》第 2 季 分集剧情共 21 集
第1集：铁轨上的泰坦2006年8月30日
一辆载有联邦参议员列车与世界著名商业大亨驾驶轿车相撞导致出轨这两个声名显赫人物当场死亡Brennan和Booth奉命调查这两人此案中否有关联犯罪现场们遇到了Jeffersonian新领导人Camille（Cam） Saroyan博士Brennan和Cam两个女人起了冲突Booth从中调解试图劝说Brennan相信Cam会有些帮助，之后Booth了解到这名大亨一家医院里从超速行驶车里甩了出来侥幸生还却成了植物人但还戴着自己冠军戒指令Brennan怀疑也与案件有关车里那名假冒者戴着大亨手表和结婚戒指唯独没有冠军戒指难道大亨本人主动参与了此事？Booth和Brennan返回去询问私人侦探因为股票丑闻曝光之后唯一一个与大亨关系亲密并有杀人嫌疑人但Booth和Brennan没有足够证据来逮捕
第2集：海湾的母子2006年9月6日
特拉华海湾发现了一具女性和胎儿遗骸，Booth和Brennan奉命前去调查尸体身份，被证实为一年前神秘失踪Carlie Richardson，失踪时候刚刚结婚，并怀有身孕。当时各大媒体曾争相报道这条爆炸新闻，Carlie的丈夫Kyle Richardson被认为本案首要犯罪嫌疑人，但就Booth和Brennan打算讯问时，也失踪了。Booth不得不申请对Kyle的搜捕令。
第3集：裹尸布中的男孩2006年9月13日
一辆垃圾车翻车现场，Brennan和Hodgins赶来参与，Booth和Cam调查垃圾堆中有一具包裹袋子里装有年轻男子尸体。Brennan发现头骨破碎，腿骨断裂，Hodgins则认为被害人垃圾堆中至少掩埋了三个星期。回到实验室Angela通过尸体面部印记，鉴定了尸体身份。与此同时Brennan和Cam因为工作方式不同经常产生矛盾相互间关系也变得很紧张对于同样强硬CamBrennan有时只能退缩求全因为两人关系僵硬到极点时候Cam威胁说要找人来取代Brennan对于那些Jeffersonian精英们来说这不仅意味着损失也意味着们必须要大小两个老板中选择支持一方
展开其余 18 集剧情
第4集：游戏中的金发女郎2006年9月20日
Booth和Brennan挖掘出一具年轻女孩遗骸时，意识到这次他们所遇到不仅仅一起简单谋杀案，实验室里Hodgins，Zack和Cam相继证明了这一点。他们发现凶手很可能是Howard Epps，一个关押了许多年的连环杀手。Brennan审判中曾出庭作证Epps，使他最终被判处死缓。
第5集：谎言中的真相2006年9月27日
Booth刚刚与前女友Rebecca床上亲热，却接到了Brennan打来电话。Brennan显然对这个女人没什么好感……电话中谈起了最近一起案件，并要求Booth到案发建筑工地上与其会面，这栋房子只建造了一部分，然后就有人发现一具，过着双重生活，表面上看起来这就一个因妒生恨并且有意骗取保险赔偿金的案子。但新出现线索让Brennan和Booth对破案方向产生了分歧，第三嫌疑人浮出水面……Booth和Brennan的新上司，即前女友Cam，在此集末尾亲热。
第6集：2103号房间中的女孩2006年10月4日
迈阿密一家酒店里发现了一具被烧死女性尸体，Brennan和Booth接到电话后，立即赶往案发现场。有迹象表明，这是哥伦比亚贩毒组织所为，他们的目标是哥伦比亚司法代表，Dolores Ramos法官，美国国务院官员Alex Radziwill介入此案，坚决要求对Ramos法官所采取一切行动以及整个案件调查都要由他说了算。官僚作风给Brennan和Booth调查带来了很多麻烦和不便，甚至们即将取得关键信息时候起了阻碍作用。Ramos丈夫和儿子进入了两人调查范围，而这起谋杀案背后真相远远超出他们的想象，更意料不到的事，国务院并不想协助他们破案，目的是为了保护凶手。
第7集：卷发的女孩2006年11月1日
该团队调查了一名 10 岁的选美明星的死亡。其他参赛者、他们的父母和他们的兄弟姐妹都成为可能的嫌疑人。霍金斯和安吉拉的约会实际上进展顺利，尽管其他人都预料到了。
第8集：沙中的女人2006年11月8日
五年前失踪联邦检察官Mason Roberts遗骸在拉斯维加斯城外沙漠里被人发现。Brennnan和Booth均怀疑死与犯罪集团有关，一只秃鹰行踪引领们发现了几码外另一具尸体：一个年轻女人新近刚被人埋下Booth认为两起案件同一人所为，但女性被害人身上所受伤显示长期遭到家庭暴力，虐待丈夫可能该对死负责。
第9集：飞船上的外星人2006年11月15日
一对五年前遭绑架双胞胎少年尸体在宾夕法尼亚州被人发现，Booth和Brennan认为这和臭名昭著连环杀手Grave Digger有关，这个恶魔惯用手法就绑架、活埋受害人，然后简单地索取高额赎金，如果钱不指定时间内支付，到位将切断联系，并留下受害人慢慢窒息而死。调查中Brennan和科学助手Hodgins成了Grave Digger下一个目标，他们不得不不见天日墓穴里来解决自己绑架问题！
第10集：树林里的无头女巫2006年11月29日
Brennan和Booth在乔治·华盛顿国家森林中艰难地穿行着，一名森林巡逻队员领他们来到犯罪现场路上。Brennan发现一些很古怪小型手工饰品挂在树上，护林队员说起了Maggie Cinders的传说－－据称18世纪80年代，一个女巫自从被人斩首之后，当地人认为鬼魂仍然附着树上的那些装饰品中，徘徊于森林之中，寻找自己头颅，任何人只要接近鬼魂就会被杀。护林队员指着一条沟，让Brennan和Booth看，里面躺着一具无头尸体。Brennen初步断定一位18－25岁左右男性，还发现了一个摄像机。
第11集：柱子上的犹大2006年12月13日
一个男人在旅馆屋顶被人射杀，凶手用衣服上帽子遮着自己脸，将受害者绑十字架上，掏出内脏给浇上油将其点燃……
第12集：牢房里的人2007年1月31日
监狱官Everett带着Brennan和Booth穿过监狱走廊，来到发生大火牢房前，牢房里仔细检查了已经烧焦尸体，Brennan早上醒来时候有些精神不振，因为昨天夜里隔壁公寓进行装修工匠们整晚都闹个不停，但当监狱官打电话来说 Howard Epps 牢房发生了火灾，她立刻睡意全无。
第13集：鳄鱼腹中的女孩2007年2月7日
Brennan 必须与另一位特工合作，而 Booth 需要看治疗师。二人组调查了一名大学新生的死亡，他参加了“Girls Gone Wild”类型的视频。
第14集：豪宅中的男人2007年2月14日
布斯和布伦南调查杰斐逊派的主要捐助者之一特伦斯·班克罗夫特 (Terence Bancroft) 的死因，他被发现死在家中。霍金斯多年前与死者妻子的关系使案件妥协。
第15集：书中的尸体2007年3月14日
布伦南和布斯必须解决三起与布伦南新畅销书中的谋杀案相同的谋杀案。
第16集：河边的无骨新娘2007年3月21日
该团队调查了一名亚洲妇女的死亡，发现她体内没有任何骨头。
第17集：墓地里的牧师2007年3月28日
一条破水管将旧墓地中的多具棺材连根拔起。当团队被带去确定重新安葬的尸体时，他们发现了一个不应该在墓地里的较新的骨架，它已经有 50 年没有使用了。
第18集：混凝土中的杀手2007年4月4日
Booth 和 Brennan 调查了在水泥中发现的部分骨架的案例。布斯认为犯罪家庭的成员应该对此负责。
第19集：陨石坑中的太空人2007年5月2日
布伦南和布斯被叫到在火山口发现死人的现场。调查将他们带到国家航天局。
第20集：老石屋里发光的骨头2007年5月9日
小组调查一具发光的尸体。霍金斯多次向安吉拉求婚。
第21集：水坑里的观星者2007年5月16日
当安吉拉画了一个老妇人的脸和一个年轻得多的人的腐烂骨架一起去时，他们很快得知受害者患有早衰症，一种衰老疾病。布斯和布伦南展开调查，发现谁会想要杀死这样一个脆弱的人。与此同时，霍金斯和安吉拉走在过道上并没有按计划进行。