分集 共13集
《机巧魔神》第 1 季 分集剧情共 13 集
第1集：机巧魔神2009年4月2日
除了被青梅竹马的幽灵附身以外很普通的智春。高中入学式前夕，为了开始独自生活而打开搬家行李的他面前，出现了一个陌生女性。
第2集：所谓的毁灭未来2009年4月9日
智春来到鸣樱宅的房东潮泉老人那里做搬家问候。但老人谜一般的话语让智春更加困惑。回家路上，智春遇到的是寄居在亲戚潮泉家的奏。
第3集：科学之光落下的影子2009年4月16日
因玲士郎操纵的机巧魔神“翡翠”的攻击，操绪消失了。奏被关押等待第一学生会的审判。愤怒的智春试图召唤“黑铁”，但附身玲士郎的哀音阻止了他。
展开其余 10 集剧情
第4集：遗失了去处的思念2009年4月23日
为了调查和捕获神秘生物，智春他们访问土琵湖。作为第一学生会会长正式委托科学部任务的玲士郎，却忍不住在意合宿中可能进展的智春和奏的关系。
第5集：纠缠在一起的心灵与身体2009年4月30日
握着银色小手提箱倒在鸣樱宅前的朱浬。但醒来后的她自称“紫浬”，连性格都像另一个人。到底发生了什么？
第6集：漂浮于黑暗中的祭品2009年5月7日
智春因感冒倒下，科学部一同战力下降。此时，瞄准朱浬持有的稳定器的瑶袭击过来。瑶的机巧魔神“白银”的力量是切割空间。
第7集：梦想散落于无情的空中2009年5月14日
因为“黑铁”安装了“稳定器”，操绪变得普通人也看得见。智春望着欢闹的操绪，想起了改变命运的3年前飞机事故。
第8集：恶运之王最小的女儿2009年5月21日
因只针对恶魔的无差别连续袭击事件，嵩月家也气氛紧张。被禁止去学校的奏忍无可忍，逃到鸣樱宅。
第9集：本应不存在的禁忌存在2009年5月28日
恶魔狩猎的犯人被查明是机巧魔神的演操者兼恶魔契约者的禁忌存在“魔神相克者（阿斯拉克莱因）”。玲士郎出现，忠告智春不要和奏契约走上同一条路。
第10集：被时光的锁链缠绕2009年6月4日
恶魔狩猎的犯人被查明是机巧魔神的演操者兼恶魔契约者的禁忌存在“魔神相克者（阿斯拉克莱因）”。玲士郎出现，忠告智春不要和奏契约走上同一条路。
第11集：身边的日常与非日常2009年6月11日
智春他们决定出席哀音的母亲雾绘主办的派对。派对进行中，雾绘讲述了哀音、玲士郎、玲子过去与现在截然不同的姿态。
第12集：直到世界枯竭2009年6月18日
科学部查明，智春在雾绘的派对上得到的肌肉像的一部分是机巧魔神的扩展功能（插件）。智春决定将神秘的扩展功能就这样寄存在第三学生会会长冬琉那里。
第13集：被诅咒的罪人之烙印2009年6月25日
为了得到伊格奈特，加贺篝劫持了修学旅行中的洛芦和高中2年级学生乘坐的飞机，向智春提出交易。在混乱状况中，智春答应了交易，但是……！？