星际之门：亚特兰蒂斯 第 2 季
2005-07-15 首播 · 共20集
随着“幽灵”的威胁日益加剧，小队竭力寻找保卫亚特兰蒂斯和飞马座星系、抵御迫在眉睫的入侵的方法。关键剧集聚焦于古科技的突破、危险的联盟以及为永远阻止敌人而孤注一掷的搜寻。
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《星际之门：亚特兰蒂斯》第 2 季 分集剧情共 20 集
第1集：围城（下）2005年7月15日
在上一季结尾，达达尼尔号战舰及时赶到亚特兰蒂斯，摧毁了来犯的两艘幽灵母舰。然而泽伦卡博士随即侦测到又有十二艘母舰正在逼近。危急关头，考德威尔上校用阿斯加德传送技术将谢泼德从自杀式任务中救回，并将一枚核弹传送至最后一艘母舰内部将其摧毁。与此同时，福特中尉被找到，贝克特医生发现他因过量注射幽灵酶而幸存下来，如今已对这种物质上瘾，且体能异于常人。
第2集：入侵者2005年7月22日
亚特兰蒂斯围城战结束两个月后，部分队员搭乘达达尼尔号从地球返回飞马座星系。漫长的航程中，麦凯博士发现一个幽灵电脑病毒侵入了战舰系统，正试图夺取飞船控制权并杀死所有人。
第3集：逃亡者2005年7月29日
植物学家帕里什博士在一颗紫外线辐射极强的星球上发现了一具幽灵尸体。贝克特医生尸检后发现其酶囊已被摘除，推测是福特所为。谢泼德与蒂拉、麦凯和洛恩少校分头搜寻，先后被击晕。醒来时谢泼德和蒂拉发现自己在一个洞穴中，面前是一位陌生人。与此同时，福特击晕了洛恩，试图说服麦凯幽灵酶是击败幽灵的关键。
展开其余 17 集剧情
第4集：二重身2005年8月5日
一支外勤小队在一颗星球上遭到幽灵飞艇攻击。麦凯和士兵劳拉·卡德曼被飞艇捕获，但因能量不足，飞艇只将麦凯实体化后便坠毁。麦凯醒来后发现卡德曼的意识竟存在于自己脑中，她能感知麦凯的一切并与他对话，甚至能暂时接管他的身体。泽伦卡博士忙于寻找分离二人的方法，而谢泼德则试图说服新盟友罗农·德克斯加入探险队。
第5集：流放之地2005年8月12日
谢泼德小队抵达一颗星球，遭到当地人攻击后被一个先进文明的飞行器救起。该文明的执政官告诉他们，星际之门所在的岛屿是一处流放地，关押着最凶恶的罪犯。这个制度数百年来成功将幽灵引向囚犯而非平民。麦凯对该文明发现的一种可裂变但无放射性的矿物产生浓厚兴趣。然而当跳跃者返回接韦尔博士前来谈判时，囚犯们开火击落了飞船。
第6集：三位一体2005年8月19日
小队访问了古人数据库中记载的多兰达星球，发现轨道上有一支被摧毁的幽灵舰队，地表一切化为灰烬，唯有一座古人建筑幸存。麦凯认出这是一座改进版的地面武器平台，古人曾在此实验利用真空能量的终极能源。麦凯坚信自己能完成古人的未竟事业。与此同时，蒂拉和罗农前往贝尔坎星球获取抗病亚麻种子，罗农得知并非所有萨蒂达人都在幽灵袭击中丧生。
第7集：本能2005年8月26日
小队到达一个村庄，村民都躲在一间酒馆里。长老戈兰称每隔约三个月就会有“戴莫斯”吸食村民的生命能量。十年前一艘飞船坠毁，村民杀光了所有怪物，只有一个幸存。罗农追踪到一个洞穴，发现了一名幽灵女孩伊利亚，她被一名叫扎迪克的男子收养了十年。扎迪克研制出了一种血清让她无需进食便可存活。贝克特医生对这种血清产生浓厚兴趣，认为这有助于完善他正在研究的将幽灵逆转为人类的逆转录病毒。
第8集：转化2005年9月9日
谢泼德被伊利亚咬伤手臂后被紧急送医，贝克特医生发现伤口竟已自行愈合。随后谢泼德体能突飞猛进，跑步胜过罗农，格斗击败蒂拉。贝克特诊断他感染了伊拉图斯虫逆转录病毒，正在向虫类转化。唯一的治疗方案是注射伊拉图斯虫干细胞。贝克特带队前往布满这种生物的洞穴采集虫卵细胞。谢泼德无法执行任务后，考德威尔上校接管指挥权，立即开始推行一系列改革。
第9集：极光号2005年9月23日
麦凯发现了一个追踪所有古人飞船位置的系统，显示仍有一艘战舰“极光号”存在于世。达达尼尔号前往调查，途中击落了一艘幽灵侦察船。极光号严重受损且无生命维持系统，全体船员已在静滞舱中休眠了一万年。麦凯发现所有船员都连接在一个虚拟现实网络中。谢泼德进入网络后得知飞船携带一份重要密报，其中提到了幽灵技术的弱点。与此同时，两艘幽灵巡洋舰逼近达达尼尔号，蒂拉和罗农发现有一只幽灵潜入了网络中的某个静滞舱。
第10集：迷失少年（上）2005年9月23日
蒂拉收到线报得知一处零能模块的线索，与谢泼德、麦凯和罗农前往接头时被击晕，通过星门被送往另一颗星球。醒来后他们见到了福特——他已组建了自己的军队，手下都是注射了幽灵酶的强化战士。他们在基地中甚至囚禁着活的幽灵以提取酶液。福特强迫麦凯、罗农和蒂拉也注射酶液让谢泼德亲眼见证效果。随后福特带队袭击基尼人的仓库以获取补给。
第11集：蜂巢（下）2005年11月16日
福特的计划彻底失败，小队被幽灵俘虏。谢泼德遭到蜂巢女王审讯，女王却突然中止审问。蒂拉感应到女王因另一艘母舰的抵达而焦躁愤怒。被困在福特基地的麦凯确信小队出了事，试图通过星门控制水晶向亚特兰蒂斯求助。小队在母舰上寻找逃脱的机会。
第12集：顿悟2005年11月28日
小队乘坐跳跃者调查太空中检测到的一处能量峰值。在地表他们发现了一个被能量场保护的山脊入口。谢泼德主动踏入能量场却无法再出来。麦凯仔细检查录像后发现，能量场内部时间流逝极快，近两个小时的录像表明谢泼德在里面已度过了很长时间。谢泼德在绝望中开始探索这片神秘空间。
第13集：临界点2005年12月5日
麦凯侦测到两艘幽灵巡洋舰出现在亚特兰蒂斯附近，但似乎并非冲着城市而来，反而像是在互相开火。更大的危机来自地球——星际之门指挥部发现勾阿乌已渗透进恐怖组织“信托”的高层。他们在亚特兰蒂斯安放了一枚炸弹，设定在地球与飞马座星系建立星门连接时引爆。亚特兰蒂斯正计划向地球发送例行汇报，时间所剩无几。无法通过星门传递警告，达达尼尔号又远在途中无法中转信息。
第14集：绝境求生2005年12月10日
麦凯试飞泽伦卡修复的一架跳跃者，与飞行员格里芬一同前往亚特兰蒂斯大陆时飞船突然故障坠入海洋。他们醒来时发现飞船正以惊人速度下沉，已在水下近四百米，每分钟继续下坠六米。水压随时可能压碎船体，而泽伦卡无法精确定位他们的位置。
第15集：高塔2005年12月19日
小队探索一颗农耕文明星球。村长埃尔德雷德带他们参观了一座为村民抵御幽灵的高塔。这座塔与亚特兰蒂斯的中心尖塔几乎一模一样，使用的正是古人的无人机武器。埃尔德雷德称有一位“护主”偶尔会向村民展示这种武器的威力。谢泼德请求安排与这位护主会面。
第16集：漫长的告别2006年1月2日
小队在太空中发现两个漂浮的物体，竟是两具静滞舱，里面分别沉睡着一男一女。贝克特判定两人的身体已过于衰老无法复活。韦尔靠近一具静滞舱时被一股能量击中昏厥，醒来后性格大变——她的意识被舱中的女子菲伯斯占据了。菲伯斯称自己来自一个被幽灵袭击的探险者种族。她表示这种意识占据只会持续几个小时，并请求与另一具静滞舱中的丈夫告别。谢泼德勉强同意让那名男子的意识进入自己体内。
第17集：政变2006年1月9日
洛恩少校及其小队被发现死在一个村庄中，尸体被烧焦。蒂拉和罗农展开调查。此时亚特兰蒂斯收到一条非计划内的星门信号，来自基尼人拉顿·拉迪姆——他曾参与科利亚占领亚特兰蒂斯的行动。拉顿称自己已叛变，正在策划推翻现任领袖考恩的政变，需要机枪、手雷和塑胶炸药作为交换，他提供一枚零能模块。据拉顿透露，基尼人已完成了核武器研发并准备用于进攻，考恩痴迷于统一整个星系。
第18集：迈克尔2006年1月16日
一名叫迈克尔·肯摩尔的中尉在医务室醒来，失去了全部记忆，只对“幽灵”和“亚特兰蒂斯”两个词有些许印象。队员们告诉他他曾是谢泼德小队成员，被幽灵俘虏后遭到了某种改造。然而整个基地对肯摩尔表现出了异乎寻常的关切和严密监控。罗农更是对他表现出毫不掩饰的厌恶。每到夜晚肯摩尔便做关于幽灵的噩梦，从队员们的反应中他渐渐察觉到自己的与众不同。
第19集：炼狱2006年1月23日
亚特兰蒂斯回应了塔拉尼斯星球的求救信号。该星球居民生活在古人建造的设施中，首领莱科斯一年前因听闻幽灵来袭而开启了护盾。如今护盾发生器出现故障，麦凯在塔拉尼斯工程师诺丽娜的协助下尝试修复。与此同时，多场地震不断撼动城市。莱科斯向谢泼德、蒂拉和罗农展示了机库中的一艘古人战舰。韦尔和谢泼德认为与该文明结盟或许是获取这艘战舰的最佳途径。
第20集：联盟2006年1月30日
一艘孤零零的幽灵母舰正朝亚特兰蒂斯驶来。阿索斯人已被转移到隐形保护下的城市，达达尼尔号和俄里翁号待命支援。韦尔希望母舰只是例行侦察，隐形护盾仍足以隐蔽城市。然而幽灵发来了音频信号——是迈克尔的声音，他表示无意攻击，而是前来谈判结盟。所有幽灵苏醒后，整个种族陷入了饥荒和内战。迈克尔希望亚特兰蒂斯帮助他们将逆转录病毒武器化，用以攻击其他幽灵派系并将其作为食物来源。作为交换，他们承诺不泄露亚特兰蒂斯的存在，并分享一切幽灵技术。